—　申报立项阶段
１．选择学校
在确定实验学校时，从三个方面进行考察：（1）校长教育管理理念；（2）科研经费保障；（3）科研队伍水平。三者缺一不可。
２. 发放课题须知
（1）研究指导方案（确定研究课题）；
（2）申报立项表。
３．审批
《学习实践魏书生教育思想，深入推进素质教育实验研究》总课题组对上报的立项表进行审批后，下发实验区、实验校立项。实验区一般建在市（地、州）、县（市、区）级教育行政或科研部门，每个实验区下属应具有10所以上实验校。
４．发放立项通知单
５．实验学校确定课题实施方案
二　实施阶段
１．辅导
（1）赴现场考察学习；
（2）专家辅导（辅导形式为区域、点、学校指导，学校承担实际发生费用）。
２．中期汇报、展示、年会研讨
三 结题、跟踪阶段
１．结题报告
２．验收
３．颁发证书
４．对参加实验的学校直接转入研究会的团体会员，校长可自然成为个人会员。
四 表彰
研究中期阶段和结题后，总课题组对先进实验区、先进实验校、先进实验工作者、先进实验教师及优秀研究成果进行表彰。